Jednostka Monitorująco-Kontrolna Europejskiego Funduszu Europejskiego Funduszu Orientacji i Gwarancji Rolnej (jak również Jednostki Monitorująco-Kontrolne dla pozostałych funduszy strukturalnych) została zlikwidowana wraz z nowelizacją Ustawy z dnia 20 kwietnia 2004 r. o Narodowym Planie Rozwoju (1), która weszła w życie w dniu 6 września 2006.
Kompetencje JMK EFOiGR przejęła Instytucja Zarządzająca Podstawami Wsparcia Wspólnoty, umiejscowiona w Departamencie Koordynacji i Zarządzania Podstawami Wsparcia Wspólnoty w MRR. Instytucja Zarządzająca PWW rozstrzyga problemy o charakterze systemowym, zgłaszane przez Instytucje Zarządzające poszczególnymi programami.
JMK EFOiGR umiejscowiona była w Ministerstwie Rolnictwa i Rozwoju Wsi, w Biurze Inspekcji Wydatków Interwencyjnych. Osoby zajmujące się kwalifikowalnością wydatków w ramach JMK EFOiGR obecnie pracują w Biurze Audytu Wewnętrznego i Kontroli MRiRW.
***
(1) - Ustawa z dnia 13 lipca 2006 r. o zmianie ustawy o Narodowym Planie Rozwoju oraz niektórych innych ustaw (Dz. U. z 2006 r. Nr 146, poz. 1074).